安徽中医药大学坐落于有“江南唇齿，淮右襟喉”之称的历史文化名城——合肥，为安徽省高等教育振兴计划“地方特色高水平大学建设”高校、安徽省高校编制备案制管理试点单位。
安徽中医药大学于1959年创立，其前身为1952年创立的安徽省中医进修班(学校)。
1959年，安徽省政府正式批准成立安徽中医学院，郭沫若先生题写校名。
1970年，安徽中医学院并入安徽医学院。
1975年，国家教育部批准恢复安徽中医学院。
2000年，安徽省医药学校并入安徽中医学院。
2011年，省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。
2013年，教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。
